En la temporada 2000/2001 comienza la andadura del Gestesa Guadalajara en categoría nacional. Participa en el grupo 'A' de la División de Plata y el entrenador elegido para dirigir desde el banquillo este proyecto es el alcarreño Juan Mena, técnico del CD Venus en etapas anteriores.
También se crea un filial, que participa en la Primera Nacional "A", con los alcarreños Ismael Mínguez y Juan Miguel Blas, como entrenadores.
El club, además, crea una estructura de base, con diferentes equipos en diversas categorías, agrupando a cerca de cien jugadores.
El proyecto es acogido con interés en la ciudad y comienza una fructífera campaña de socios que congrega a cerca de 400 abonados. Además, según iba transcurriendo la temporada y el equipo iba acercándose a las posiciones de privilegio de la clasificación, las gradas del pabellón de juego (polideportivo Municipal de Guadalajara) iban registrando óptimas entradas.
En esa temporada, el Gestesa quedó cuarto clasificado, empatado a puntos con el tercero (Real Jaén), en una campaña en la que jugaban los play-off de ascenso los tres primeros de ese grupo, manteniendo hasta el último partido de la liga regular las opciones de situarse en los puestos de privilegio.
.: Los rivales
Los rivales del equipo alcarreño en esta temporada, en el grupo 'A' de la División de Plata, donde los desplazamientos eran a la zona centro y el sur del país fueron:
Atlético Boadilla (Madrid)
Levitt Las Rozas (Madrid)
Real Jaén (Jaén)
Leganés FS (Madrid)
Melilla FS (Melilla)
Olías del Rey (Toledo)
Virgili Granada 74 (Granada)
UMA Velez (Málaga)
ONO San Fernando (Cádiz)
Racing de Ceuta (Ceuta)
Bargas (Toledo)
Sobrado (Madrid)
Playas de Málaga (Málaga)
Carrizos (Canarias)
Rayo Lorea II (Madrid)
.: La plantilla
La plantilla del Gestesa Guadalajara en esa temporada fue la formada por:
| NOMBRE | PUESTO | PROCEDENCIA |
| Jorge González | Portero | CD Centenera |
| Ismael Gil | Ala | CD Venus |
| Ramón Santos "Ramoncito" | Ala | CD Centenera |
| Rafael Cid "Rafa Cid" | Ala | |
| Abdelilah Benaim "Abdel" | Ala | Ceuta |
| Jesús M. Sánchez "Chechu" | Ala | CD Venus |
| Carlos Vallejo "Vallejo" | Cierre | |
| Roberto Espinosa "Espinosa" | Ala | CD Venus |
| Gustavo Muñoz | Pívot | Leganés |
| Manuel Delgado "Manolo" | Portero | Caja Segovia |
| David Pintado | Cierre | |
| Roberto García | Ala | CD Venus |
| Alessandro Vasconcelos "Alé" | Ala | Valencia Vijusa |
| J. Fernando Fortea "Fortea" | Portero | FS Alamín |
Cuadro técnico:
Juan Mena (Entrenador)
Juan Antonio de Luz (Delegado)
Martín Villar (Preparador Físico)
El equipo contaba con dos jugadores extracomunitarios, el marroquí Abdel, que había sido internacional con su país y elegido mejor jugador de la Copa de África y el brasileño Alé, que llegaba del Valencia Vijusa, equipo de División de Honor.
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